Née dans le Massachusetts, elle possède huit frères et sœurs. Elle est  membre du Phi Beta Kappa, un club d’étudiants que l’on dit brillants et diplômée du Radcliffe College en 1907. Elle obtient sa maîtrise en 1916 à l’université de Californie. Ses études terminées, la jeune Margaret donna des cours dans diverses écoles comme Cambridge, Dedham et Boston. En 1912 elle reçoit une bourse universitaire pour le  Nantucket Maria Mitchell Observatory, « un petit observatoire construit en mémoire de la première femme astronome des États-Unis. » (wikipedia). Elle est nommée directrice de l’observatoire et y restera jusqu’en 1957. Margaret  Harwood se spécialisera dans la photométrie, à savoir la variation de luminosité des étoiles et astéroïdes, et plus particulièrement de l’astéroïde Eros. Elle est membre de la société américaine d’astronomie et de la Royal Astronomy Society (GB). Elle donnera aussi de nombreux cours au MIT.